Zdecydowali o tym radni podczas niedzielnej sesji rady stolicy. Zanim rozpoczęli głosowanie w sprawie upamiętnienia papieża-Polaka oraz jego nauk, prezydent Lech Kaczyński przekonywał, że Warszawę stać na takie inwestycje. – Jesteśmy miastem stosunkowo bogatym, nie będzie to uszczerbek dla naszego budżetu – stwierdził prezydent. Celem działania Centrum Myśli Jana Pawła II jest nie tylko badanie pozostawionych przez papieża tekstów, ale także upowszechnianie jego nauki, na przykład przez tworzenie opartych na niej programów edukacyjnych, organizowaniu odczytów, wykładów i spotkań poświęconych papieżowi. Centrum Myśli Jana Pawła II ma być zlokalizowane w pałacu Saskim, w sąsiedztwie placu Piłsudskiego, na którym papież celebrował msze podczas swoich odwiedzin w stolicy. Będzie można tam m.in. kupić papieskie pamiątki i książki. Natomiast stypendia im. Jana Pawła II będą przyznawane uczniom i studentom, którzy mimo trudnych warunków życiowych lub problemów ze zdrowiem, osiągną dobre wyniki w nauce. Dostaną oni od miasta pieniądze, a także będą mogli uczyć się za granicą.