Dzięki specyficznemu mikroklimatowi panującemu w krypcie złożone w niej zwłoki uległy procesowi mumifikacji. By zbytnio nie narażać mumii, zwiedzający do podziemi wpuszczani są tylko w okresie Wszystkich Świętych. W kryptach spoczywa około 70 zmumifikowanych ciał. W ostatnich latach z powodu zmian wilgotności w krypcie mumie zaczęły niszczeć. Podziemia zostały całkowicie zamknięte dla zwiedzających. Dzięki wykonaniu specjalnej izolacji i prac remontowych udało się przywrócić specyficzny mikroklimat sprzyjający mumifikacji. To jedyny w Polsce tak wielki zbiór mumii, które powstały bez ingerencji człowieka. Znajdują się tu m.in. ciała członków rodzin Wielkopolskich, Załuskich. Spoczywają tu także żołnierz napoleoński i zakonnicy. Kryptę można zwiedzić w godz. 11.00-15.00 i 18.00-20.00.