Przez ostatnich 30 lat prowadził ją we współdziałaniu z Biurem Wysokiego Komisarza Narodów Zjednoczonych ds. Uchodźców. Dalsza współpraca okazała się jednak niemożliwa, odkąd przedstawicielstwo tej ONZ-owskiej agencji w Ekwadorze podjęło kontrowersyjną decyzję popierania projektów i organizacji pozarządowych wątpliwego pochodzenia. Już od kilku lat współdziała tam ono z organizacjami pozarządowymi wykluczającymi udział społeczeństwa i Kościoła w decyzjach, które podejmują wspólnie z rządem. Ze względu na dobro uchodźców jest to nie do przyjęcia. Dlatego episkopat Ekwadoru zdecydował z dniem 1 stycznia 2007 r. przerwać współpracę z Biurem Wysokiego Komisarza, by troszczyć się o uchodźców zgodnie z własnym rozeznaniem potrzeb. Szczególnej pomocy udziela im duszpasterstwo społeczne 6 ekwadorskich diecezji.