W wywiadzie dla dziennika "Avvenire" przypomniał, że "świecki charakter państwa narodził się w ciągu dziejów tam, gdzie nie było chrześcijaństwa. Istnieje więc dusza kontynentu, która należy ocalić, chrześcijaństwo zaś należy do samej natury Europy". Powyższe słowa stanowiły odpowiedź przewodniczącego Komisji Europejskiej na pytanie, czy są szanse na to, że w przyszłej konstytucji Unii Europejskiej znajdzie się odwołanie do chrześcijańskich korzeni naszego kontynentu. Prodi uważa, że "w zasięgu ręki jest ogromna okazja, by położyć kres przeciwstawnym radykalizmom: między klerykałami i antyklerykałami". W sprawie uznania w Kościołach i związkach wyznaniowych partnerów w dialogu ze wspólnotą, przewodniczący Komisji Europejskiej jest przekonany, że "należy przezwyciężyć oświeceniową opinię, iż dialog prowadzi się tylko z pojedynczym obywatelem". "Rząd Europy musi utrzymywać stałe relacje z formacjami społecznymi, a do nich bez wątpienia należą także Kościoły" - mówi Romano Prodi w wywiadzie dla dziennika włoskiego Episkopatu.