Na lotnisku międzynarodowym w Zdarze Papieża pożegnali prezydent Stipe Mesić, premier, chorwacki episkopat, członkowie rządu i władz lokalnych. Ceremonia pożegnania odbyła się bez udziału wiernych i przemówień. Orkiestra wojskowa odegrała hymny Watykanu i Chorwacji. Trzecia pielgrzymka Jana Pawła II w Chorwacji przebiegała pod hasłem "Rodzina drogą Kościoła i narodu". W dniach 5-9 czerwca Papież odwiedził pięć miast: Rijekę, Dubrownik, Osijek, Djakovo i Zadar. W Dubrowniku beatyfikował siostrę Marię od Ukrzyżowanego Jezusa Petković, pierwszą w dziejach Chorwatkę.Jan Paweł II jeszcze w tym miesiącu po raz drugi uda się na Bałkany: 22 czerwca odwiedzi Banja Lukę w Bośni i Hercegowinie, gdzie ogłosi błogosławionym świeckiego Ivana Merza.