Szenuda III jest już 117. przywódcą największej chrześcijańskiej społeczności na Bliskim Wschodzie. 14 listopada obchodził 35. rocznicę wyboru na papieża Kościoła koptyjskiego. Wiernych bardzo niepokoił jego stan zdrowia. Duchowny w tym roku dwukrotnie już szukał pomocy u lekarzy w Stanach Zjednoczonych z powodu poważnych problemów z kręgosłupem. Doszło do tego, że w lipcu koptyjski ksiądz Max Michel ogłosił się arcybiskupem Maximusem I i proklamował powstanie nowego Kościoła. - Kościół nie miał jeszcze tak złego papieża jak Szenuda. W Egipcie nigdy nie dochodziło też do tak ostrych starć sekciarskich jak za jego panowania - powiedział Maximus I dziennikowi "Al Masry al Youm". Wówczas Szenuda III przerwał leczenie i wrócił do Egiptu, by zapobiec schizmie. Lojalni wobec papieża Koptowie złożyli zaś w egipskim sądzie pozew, żądając ukarania Maximusa I za zniesławienie Szenudy III. Sędzia odrzucił pozew. W zdominowanym przez muzułmanów Egipcie Koptowie, stanowiący 10 proc. mieszkańców 73-milionowego kraju, nie mają łatwego życia. Często padają ofiarą antychrześcijańskich incydentów. W Wielki Piątek muzułmanie zaatakowali kościoły w Aleksandrii. Dwóch Koptów zostało zasztyletowanych. 40 osób zostało rannych w zamieszkach. Na ulice wyszły setki chrześcijan, protestując przeciw prześladowaniu Koptów. Koptowie wciąż nie mogą też porozumieć się z Watykanem. Od Kościoła katolickiego odeszli w 1054 roku. Gdy Jan Paweł II pielgrzymował do Egiptu, Szenuda III odmówił spotkania się z nim. Był też jedynym chrześcijańskim przywódcą, który skrytykował Benedykta XVI za jego wykład o islamie wygłoszony podczas ostatniej pielgrzymki do Niemiec.