Poinformował o tym w specjalnym komunikacie prasowym przesłanym KAI rektor uczelni ks. prof. Jan Maciej Dyduch. PAT jest uczelnią kościelną, zatem nie musi poddawać się lustracji. Rektor PAT argumentuje przeprowadzenie procedury lustracyjnej w uczelni poszanowaniem prawodawstwa polskiego. "To znak solidarności z innymi uczelniami w Polsce" - napisał w komunikacie. Przypomnijmy, że uczelni kościelnych, podlegających Stolicy Apostolskiej, nie obowiązuje ustawa lustracyjna. Ich pracownicy naukowi nie muszą składać oświadczeń. Dotyczy to także seminariów duchownych diecezjalnych i zakonnych. Porozumienie w tej sprawie uzyskano podczas rozmów między Komisjami Konkordatowymi - kościelną i rządową. Wynika to z postanowień konkordatu pomiędzy Stolicą Apostolską a Rzeczpospolitą Polską. Kościół, zgodnie z Konstytucją i konkordatem, w swoich sprawach kieruje się własnym prawem. Dlatego uczelnie kościelne, podlegające Stolicy Apostolskiej: Papieska Akademia Teologiczna w Krakowie, Papieski Wydział Teologiczny we Wrocławiu, Papieski Wydział Teologiczny w Warszawie z dwiema sekcjami - Bobolanum i św. Jana Chrzciciela oraz jezuickie Ignatianum w Krakowie nie podlegają ustawie lustracyjnej. Dotyczy to także wszystkich seminariów duchownych diecezjalnych i zakonnych. Ta autonomia nie obejmuje Uniwersytetu Kardynała Stefana Wyszyńskiego, Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego ani wydziałów teologicznych, które działają na uczelniach państwowych. Pracownicy tych uczelni muszą poddać się lustracji. Papieska Akademia Teologiczna w Krakowie przejęła tradycje zasłużonego dla kultury narodu i Kościoła w Polsce Wydziału Teologicznego Jagiellońskiej Wszechnicy. W 1959 roku Stolica Apostolska wydała dekret stwierdzający, że "Wydział Teologiczny zgodnie z jego ustanowieniem i charakterem trwa pod kierownictwem jednej władzy kościelnej i na przyszłość ma się kształtować wedle praw ustanowionych przez Stolicę Apostolską". Dzięki staraniom kardynała Karola Wojtyły Wydziałowi został przyznany w 1974 roku zaszczytny tytuł Papieski. Przełomowym wydarzeniem w dziejach Wydziału Teologicznego w Krakowie było wydanie przez Ojca Świętego Jana Pawła II dnia 8 grudnia 1981 roku Motu proprio Beata Hedvigis, na mocy którego ustanowiona została Papieska Akademia Teologiczna w Krakowie, składająca się z trzech wydziałów: teologii, filozofii i historii Kościoła.