Benedykt XVI zwrócił uwagę, że terroryzm jest jednym z największych zagrożeń jedności Indonezji, gdyż podważa podstawy społeczeństwa – zwłaszcza, kiedy powołuje się na imię Boga. Kościół, wierny nauczaniu Chrystusa, wyraźnie potępia manipulowanie religią w celach politycznych. Indonezja – przypomniał Ojciec Święty – to kraj wieloreligijny, a równocześnie mający największą na świecie liczbę muzułmanów. Odgrywa ważną, pozytywną rolę w promowaniu współpracy wyznawców różnych religii, także w skali międzynarodowej. Katolicy są tam niewielką mniejszością, służą jednak rozwiniętą siecią placówek oświaty i służby zdrowia wszystkim współobywatelom niezależnie od wyznawanej przez nich religii. Papież wyraził nowemu indonezyjskiemu ambasadorowi nadzieję, że niedawne (23 lutego 2006 r.) przystąpienie jego ojczyzny do Międzynarodowego Paktu Praw Osobistych i Politycznych pomoże w dalszym umacnianiu wolności poszczególnych chrześcijan oraz ich instytucji. Będąc obecnie niestałym członkiem Rady Bezpieczeństwa ONZ Indonezja może wnieść owocny wkład w rozwiązywanie globalnych konfliktów, szerzenie pokoju i międzynarodowej solidarności.