Choć dokładny program nie jest jeszcze znany, najprawdopodobniej 28 września w uroczystość św. Wacława Papież będzie w Pradze i w pobliskiej miejscowości Stará Boleslav, gdzie czeski książę poniósł śmierć za wiarę. Biskupi morawscy zabiegają, by Ojciec Święty odwiedził również Morawy, w tym administracyjną stolicę regionu, Brno, które nigdy nie znalazło się w programie podróży Jana Pawła II. Głównym miejscem spotkania Papieża z tym najbardziej katolickim regionem Republiki Czeskiej, w którym żyje trzy czwarte tamtejszych katolików, byłby jednak Welehrad, dawna stolica Państwa Wielkomorawskiego, do której mieli przybyć święci Cyryl i Metody. Kard. Miloslav Vlk zdradził dziennikarzom, że inicjatywa podróży wyszła od samego Papieża. Starałem się, by Benedykt XVI odwiedził nas przy okazji wizyty w Bawarii czy w Austrii. Papież widocznie nosił to zaproszenie w sercu i teraz sobie przypomniał – powiedział metropolita Pragi. Zdaniem prymasa Czech w Starym Boleslaviu Papież mógłby się spotkać z młodzieżą, a w Pradze ze światem nauki. Wizyta będzie miała charakter oficjalny. Dlatego jej koordynatorem został szef protokołu w kancelarii prezydenta Jindřich Forejta. Ze strony kościelnej nad organizacją pielgrzymki będzie czuwał praski biskup pomocniczy Václav Malý.