Zgromadzenie Generalne jest najwyższym gremium GEKE. Jego spotkania, podczas których omawiana jest dotychczasowa działalność i kierunki pracy na przyszłość, odbywają się co sześć lat. Ostatnie zgromadzenie obradowało w 2006 r. w Budapeszcie. Obrady we Florencji odbędą się na zaproszenie trzech Kościołów obecnych we Włoszech: luterańskiego, metodystycznego oraz Waldensów. Florencja jest ważnym miejscem dla protestantyzmu włoskiego, ale także europejskiego - zwraca uwagę przewodniczący GEKE, Thomas Wipf. W rozmowie z austriacką agencją katolicką „Kathpress” protestancki ksiądz z Berna przypomniał, że już w czasach Reformacji z Florencji wychodziły ważne impulsy reformatorskie, a GEKE czuje się spadkobiercą tej tradycji. Wspólnota Kościołów Ewangelickich w Europie skupia 105 Kościołów protestanckich z 29 krajów naszego kontynentu oraz Republiki Południowej Afryki. Na mocy tzw. Konkordii Leuenberskiej z 1973 r. Kościoły luterańskie, reformowane, metodystyczne, a także Kościół waldensów zobowiązały się do wspólnoty ołtarza, stąd też bierze się używana czasem nazwa Lauenberska Wspólnota Kościołów. Sekretariat generalny GEKE znajduje się w Wiedniu, a od 2007 r. sekretarzem generalnym jest austriacki biskup Kościoła luterańskiego Michael Bünker.