W wygospodarowanych na potrzeby muzeum pomieszczeniach będzie można zobaczyć m.in. fotel z cesarsko-królewskimi emblematami, na którym przez kilkanaście minut siedział podczas wizyty w 1880 r. Franciszek Józef I, oraz inne unikatowe przedmioty związane z historią, obchodzącego w tym roku 300-lecie istnienia, cieszyńskiego zboru. Muzeum Protestantyzmu powstało na niewykorzystanym dotąd balkonie, który został oddzielony od reszty kościoła i wyremontowany. Muzeum gromadzi wiele zabytkowych eksponatów, które były przechowywane w różnych miejscach świątyni i innych budynkach parafialnych. Jak zauważa historyk Maciej Oczkowski, jeden organizatorów przedsięwzięcia, wiodącym tematem ekspozycji jest kościół Jezusowy i jego historia. „Ale przypominamy także o wydarzeniach, które miały znacznie nie tylko dla parafii cieszyńskiej, ale dla całego regionu Śląska Cieszyńskiego. Będzie to dodatkowa atrakcja turystyczna dla odwiedzających świątynię. Poza tym w kościele mieści się już biblioteka i archiwum im. Tschammera” – zauważa Oczkowski. Wystawa, gromadząca liczne przykłady luterańskiego piśmiennictwa, podkreśla wielokulturowość i wielojęzyczność ewangelików cieszyńskich. Można tu będzie zobaczyć m.in. kilkukilogramowy zamek do kościelnych drzwi z 1714 r., zabytkową fisharmonię czy orzełka osadzonego na żerdzi z 1709 r., który oznaczył niegdyś miejsce budowy kościoła na mocy edyktu cesarza Józefa I. Powstanie muzeum było możliwe dzięki wsparciu ze środków Mechanizmu Finansowego Europejskiego Obszaru Gospodarczego związanego z realizacją projektu „Ochrona i konserwacja cieszyńskiego dziedzictwa piśmienniczego”. Kwota dotacji to około 1,6 mln zł. Otwarcie placówki zapoczątkuje obchody 300-lecia cieszyńskiego kościoła Jezusowego. Późnobarokowy cieszyński kościół Jezusowy był aż do wydania w 1781 r. przez cesarza Józefa II patentu tolerancyjnego jedyną świątynią ewangelicką na Śląsku Cieszyńskim. Usytuowanie świątyni na zboczu wzgórza powoduje, że jest widoczna z trzech stron i dominuje nad Cieszynem. Muzeum Reformacji Polskiej istnieje także w Mikołajkach na Mazurach.