Relikwie świętego ojca wschodniego chrześcijaństwa trafiły do Moskwy w XVII w. Przywiezione zostały z góry Atos. Do 1922 r. przechowywano je w kremlowskim soborze Zaśnięcia Matki Bożej. W latach 1930-1988 przechowywano je w zbiorach Fundacji Rosyjskiego Srebra z XIX w. 26 maja 1988 r., po nastaniu odwilży pierestrojki, wiele różnych relikwii, w tym św. Jana Chryzostoma oficjalnie przekazano członkom Świętego Synodu rosyjskiego prawosławia. Uroczystość odbyła się w pomieszczeniach Kremlowskiej Orużennej Pałaty (zbrojowni). Miejscem stałego pobytu i adoracji relikwii św. Jana Chryzostoma został odbudowany moskiewski sobór Chrystusa Zbawiciela.