Siedzibą uniwersytetu staną się pomieszczenia kompleksu świątynnego św. Jana Teologa-Ewangelisty w moskiewskiej dzielnicy Kitaj-Gorod. W pomieszczeniach tych do tej pory znajdował się Instytut Teologiczny, którego rektorem był igumen Piotr Jeriemiejew. On też został pierwszym rektorem powołanego do życia Uniwersytetu Prawosławnego.

Zgodnie ze słowami patriarchy Cyryla zamieszczonymi w dekrecie, uniwersytet będzie instytucją wyższego kształcenia zawodowo-religijnego spełniającą standardy religijne i świeckie.

Rektor igumen Piotr Jeriemiejew uważa, że głównym zadaniem uniwersytetu ma być „realizacja modelu rozwoju wyprzedzającego, elastycznie dostosowującego działalność do światowych i rodzimych tendencji w nauce i oświacie”.

„W przygotowaniu działalności uniwersytetu wezmą udział zaproszeni specjaliści, przekonani o konieczności otwarcia nowej płaszczyzny kształcenia, ukierunkowanej na dokonanie syntezy wiedzy teologicznej ze współczesną nauką – stwierdził rektor-nominat. – Ma to zapewnić aktualizację religijnego i moralnego nauczania Kościoła prawosławnego w obliczu wyzwań stojących przed współczesnym człowiekiem”.

Aggiornamento, aktualizacja nauczania Kościoła, ogłoszone przez Jana XXIII przed zwołaniem II Soboru Watykańskiego, do niedawna oficjalnie odrzucane przez rosyjskie prawosławie, obecnie staje się faktem.