Ivan Jurkovič urodził się 10 czerwca 1952 r. w Kočevju w Słowenii. 29 czerwca 1977 r. przyjął święcenia kapłańskie jako duchowny archidiecezji lublańskiej. W 1984 r. rozpoczął pracę w dyplomacji watykańskiej. Pracował w nuncjaturach w Korei Południowej i Kolumbii. W latach 1992-95 był doradcą przedstawicielstwa Stolicy Apostolskiej w Federacji Rosyjskiej.

W 2001 r. Jan Paweł II mianował go arcybiskupem i nuncjuszem apostolskim na Białorusi. Sakrę biskupią przyjął 6 października tegoż roku z rąk watykańskiego sekretarza stanu kard. Angelo Sodano. Od 2004 r. był nuncjuszem apostolskim na Ukrainie.

Obecnie zastąpi w Rosji abp. Antonio Menniniego, którego po blisko dziewięcioletniej pracy w Moskwie papież mianował nuncjuszem w Wielkiej Brytanii.

Obserwatorzy zwracają uwagę, że abp Jurkovič posiada bogate doświadczenie w dyplomacji watykańskiej, szczególnie w krajach byłego Związku Radzieckiego.