Wspominając swoje pierwsze spotkanie z Episkopatem Polski i zawierzenie posługi nuncjusza apostolskiego w Polsce Matce Bożej Jasnogórskiej, abp Józef Kowalczyk wraz z biskupami odmówi swoje dziękczynienie i dalsze zawierzenie Jej opiece
Na Jasnej Górze rozpoczęły się doroczne rekolekcje Episkopatu Polski. Jutro o godz. 7.45 Mszy Świętej z Jutrznią w Kaplicy Matki Bożej przewodniczył będzie abp Józef Kowalczyk. Nuncjusz apostolski wygłosił homilię.
Arcybiskup Kowalczyk rozpoczął uroczyście misję apostolską w Polsce podczas Mszy św. w warszawskiej katedrze św. Jana Chrzciciela 26 listopada 1989 r. Następnego dnia modlił się na Jasnej Górze wraz z polskimi biskupami, odbywającymi doroczne rekolekcje. Matce Bożej Jasnogórskiej i wstawiennictwu świętych patronów Polski zawierzył siebie i swoją misję, polecając się równocześnie modlitwom pasterzy i wiernych.
„Episkopat Polski z radością i szacunkiem powitał pierwszego po 50 latach nuncjusza apostolskiego w Polsce” – napisali biskupi w komunikacie po obradach plenarnych tuż po tamtych rekolekcjach. Jak wyjaśniali, „przyjazd nuncjusza jest wyrazem przemian, które zaszły w Polsce, oraz dowartościowaniem roli i miejsca Kościoła w naszej Ojczyźnie”.
Listy uwierzytelniające nowy nuncjusz apostolski w Polsce złożył ówczesnemu prezydentowi Wojciechowi Jaruzelskiemu 6 grudnia 1989 r. w Warszawie.
"Śmiało można powiedzieć, że pielgrzymujemy. My przedstawiciele władz państwowych (...)".
"Nieumyślne narażenie na niebezpieczeństwo utraty życia lub ciężki uszczerbek na zdrowiu"
Tylko czerwcu i lipcu strażacy z tego powodu interweniowali ponad 800 razy.