Dotychczasowy dyrektor Centrum płk Dusza nie mógł zostać skutecznie odwołany ze stanowiska, bo nie otrzymał decyzji ministrów obrony Polski i Słowacji w tej sprawie, a taki jest wymóg. Nie było w tej sprawie także opinii Komitetu Sterującego - ciała nadzorującego całość działań Centrum, w skład którego wchodzi 10 krajów. Centrum Eksperckie Kontrwywiadu NATO jest niezależną międzynarodową instytucją, która nie podlega i nie jest częścią polskiego MON. Słowacki minister obrony Glváč stwierdził, że nie może zaakceptować niestandardowych działań podjętych w sprawie centrum eksperckiego NATO. Stanowczo zaprzecza też stwierdzeniom, że nocne wejście na jego teren było konsultowane ze stroną słowacką. Zatem działanie polskiego MON było bezprawne.